Die Schmerzklinik Kirschgarten wurde im Jahr 1978 durch den Rheumatologen G. Kaganas gegründet. Im Jahre 1986 wurde die Klinik von Gallacchi Guido und zwei weiteren Ärzten übernommen.
Den Namenswechsel von Schmerzklinik Kirschgarten auf Schmerzklinik Basel erfolgt im 2010. Im Jahre 2013 wurde die Klinik bereits anteilweise in das Swiss Medical Network integriert und im Februar 2014 wurde sie ganzheitlich in das Netzwerk integriert und ist somit Teil eines der grössten medizinischen Netzwerken der Schweiz, welche in allen drei Sprachregionen der Schweiz vertreten ist.