La Schmerzklinik Kirschgarten a été fondée en 1978 par le rhumatologue G. Kaganas. En 1986, la clinique a été reprise par Gallacchi Guido et deux autres médecins.
Le changement de nom de le Schmerzklinik Kirschgarten en Schmerzklinik Basel a eu lieu en 2010 et en 2013, respectivement en février 2014, la clinique a été intégrée dans le Swiss Medical Network.